分子从液相主体扩散到蒸发表面。一般来说,液相中的扩散速度是控制分子蒸馏速度的主要因素,因此应尽可能减薄液层厚度,加强液层流动。 自由蒸发液层表面的分子随着温度的升高,蒸发速度不断上升。然而,随着温度的升高,分离因素有时会降低。因此,必须以加工材料的热稳定性为前提,选择经济合理的蒸馏温度。 分子从蒸发表面飞到冷凝表面在蒸汽分子从蒸发面向冷凝面喷射的过程中,它们可能相互碰撞,也可能与两侧的剩余空气分子相撞。由于蒸发分子比空气分子重得多,而且大多数运动方向一致,它们自身的碰撞不会对喷射方向和蒸发速度产生很大影响。然而,残余气体分子的无序热运动状态呈现在两侧,因此影响喷射方向和蒸发速度的主要因素是残余气体分子的数量。 冷凝面上的分子冷凝如果冷凝面的形式合理光滑,只需要使冷热面之间的温差足够(通常在70-100℃范围内),那么就认为冷凝面可以瞬间完成,所以选择合理的冷凝器是非常重要的。
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